【水资源】  连州市河流属北江（珠江支流）支流连江水系。市内主要河流有星子河、东陂河、三江河、九陂河，四条河流汇合称为连江。其中星子河流域和东陂河流域面积占全市总面积的92%。截至2018年末，全市共有山塘水库831座，其中大型水库1座、中型水库1座、小（一）型水库11座、小（二）型水库39座、小于10万立方米的山塘水库785座（其中重点山塘184座），共有总库容2.53亿平方米，灌溉6346.67公顷农田。

【生物资源】 连州市山地面积广阔，土壤肥沃，气候温和，雨量充沛，为我国典型的亚热带常绿阔叶林区，适于多种生物资源繁衍生息，既有历史上保存下来的生物资源，又有新的种群，既有南下的生物资源，又有北上的种类，因而生物资源极其丰富，是广东省较大的再生能源基地和生物基因库之一。

植物种类  据调查连州市有蕨类植物48科383种；有裸子植物10科61种；被子植物（双子叶植物156科2800余种和单子叶植物30科708种）共计3956种（含栽培种），其中药用植物1500多种，材用植物1000多种；牧草植物1200余种；花卉、观赏植物500多种；芳香、油料植物400余种；纤维植物300余种；野果、淀粉植物200余种等。分布于连州市属于国家保护的珍稀濒危植物有：一级保护的南方红豆杉、伯乐树、报春苣苔等3种；二级保护的有福建柏、长柄双花木、伞花木、白豆杉、观光木、银杏、香果树、广东松、半枫荷、红椿、华南栲、喜树等30多种。

野生动物资源  据调查连州市有野生动物500多种，其中兽类有100多种，鸟类200多种，爬行类90多种，两栖类30多种，鱼类30多种。属国家重点保护的动物有30多种，其中国家一级保护动物有华南虎、黄腹角雉、云豹、金钱豹、蟒蛇、金雕、白颈长尾雉等10多种。属国家二级保护的动物有红面猴、穿山甲、大小灵猫、白鹇、苏门羚、水鹿、狗熊、毛冠鹿、虎皮蛙、金猫和猛禽类等30多种。

主要森林植被类型  常绿阔叶林：根据森林的组成成分，结构特征及生境特点，连州市的常绿阔叶林可分为低山常绿阔叶林和中山常绿阔叶林。丘陵（低山）常绿阔叶林，分布于清水、瑶安、丰阳一带海拔200—999米的低山丘陵沟谷或北向山坡上，土壤为红壤。中山常绿阔叶林，分布于潭岭（大东山保护区），朝天大东山一带海拔1000米以上的山地上，土壤为黄壤。落叶阔叶林：主要分布石灰岩地区及海拔1000米以上局部山地。常见类型有麻栎林、黄连木、枫香林。海拔1200米以上分布长柄毛榉、光皮桦林。山地常绿落叶阔叶混交林：连州市的低山及中山山地上，因海拔升高，气温降低，而常出现主要由壳斗科、桦木科、棒木科、金缕梅科和安息香科的落叶树种与壳斗科、樟科、山茶科、木兰科、杜鹃花科的常绿树种组成的山地常绿落叶阔叶混交林类型。针叶林：低山丘陵地区主要分布为天然或人工种植的马尾松、湿地松、杉木林。潭岭（大东山自然保护区）海拔1000米以上分布有马尾松、黄山松、广东五针松、长苞铁杉等天然针叶林。经济林：连州市的经济林主要有油茶林、毛竹林、梨果、柑橘等。油茶林主要分布于山塘、清水、清江、九陂等地。毛竹林主要分布于瑶安、三水、丰阳、朱岗等地。杂果园：连州市主要树种有梨、柑、橙、橘、桃、李、梅、枇杷、枣、黄皮、柿、栗等20多种，其中除柑、橙、柚、梨、枣等连片栽培面积较大以外，其余种类都是在农家屋前后零星种植。灌木草丛：主要灌木草丛有常绿阔叶灌木草丛、石灰岩藤本灌木草丛和山顶灌木草丛。常绿阔叶灌木草丛：主要分布于丘陵地区，灌木的优势种类为乌饭树、布荆、柃木、桃金娘等。石灰岩藤本灌木草丛：是由石灰岩丘陵常绿落叶阔叶混交林破坏后形成的，主要由灌木、藤状灌木及草本植物交织构成，结构密实而杂乱，很多种类具有喜钙、硬叶、多刺、肉质的耐旱特征。常见的优势种类有布荆、金丝桃、红背麻秆、竹叶椒、全缘火棘、沿阶草等。山顶灌木草丛：分布北部、东部的天堂岭、潭岭（大东山自然保护区）、天光山、方山、石坑山等地海拔1300米以上的山坡或山头顶部。7.草丛：主要草丛有山地草丛、丘陵岗地草丛和紫色页岩丘陵草丛。山地草丛：分布海拔1000米以上山顶、山脊，主要种类有野古草、芒、地耳草、蕨、华南龙胆、一枝花黄等。丘陵岗地草丛：分布500米以下丘陵岗地草坡，多为放牧、撂荒而成，主要种类有野古草、毛鸭嘴草、金茅、鹧鸪草、蜈蚣草等。紫色页岩丘陵草丛：优势种类主要为龙须草、白茅、臭根草、牧蒿、夏枯草等。          

【土地资源】  连州市土地资源丰富，全市有耕地面积40060.39公顷，其中水田24262.5公顷，水浇地108.05公顷，旱地15689.84公顷；园地4901.48公顷，其中果园3846.58公顷，茶园6.52公顷；林地181784.55公顷，其中有林地138343.99公顷，灌木林地22007.79公顷，其他林地21432.77；草地 19325.7公顷，其中人工牧草地7.5公顷，其他草地19318.2公顷。       

【矿产资源】  连州矿产资源丰富，探明的矿物种类主要有煤、铁、锰、铜、钼、铅、锌、锑、锡、钽、磷、砷、硅灰石、白云石、大理石、花冈石、滑石、石墨、石膏等23种，其中煤炭蕴藏量达 8000 万吨，主要分布在九陂、龙坪、保安镇等；锰矿储量达 400 万吨，为广东锰矿主要产地之一，主要分布在西岸、星子、大路边镇等。硅灰石储量达 364.85万吨，是广东省的主要产地。大理石（碳酸钙）储量达 14.89亿吨，且品位和纯度均为全国最高，是独有的特色资源。硅灰石、大理石（碳酸钙）主要分布在西江、龙坪、星子、大路边镇。

【旅游资源】  连州市旅游资源丰富，是粤西北清远地区旅游资源大县之一。其中自然类旅游资源有：连州地下河、湟川三峡—龙潭文化生态旅游度假区、潭岭天湖、连州天龙峡、大东山温泉度假区、瑶安天光山百里摄影长廊、大东山自然保护区、茅坪原始生态风景区、杨梅洞、车田上田温泉等11处。其中，地文景观类包括连州地下河、瑶安天光山百里摄影长廊、杨梅洞等；水域风光类包括湟川三峡—龙潭文化生态旅游度假区、潭岭天湖、连州天龙峡、大东山温泉度假区、茅坪原始生态风景区、车田上田温泉等。