连州市地处南岭之中的萌渚岭南麓，境内崇山峻岭，丘陵冈峦星罗棋布。主要山脉有绵延丰阳、瑶安一带的簸箕山脉，主峰天堂岭，海拔1712米，为市内最高峰，位于瑶安与湖南省兰山县交界处;横跨东部潭岭、朝天、西江一带的大东山山脉，主峰岩坑山，海拔1604米，为内市第二高峰，位于朝天与阳山交界处;其余山岭多在海拔1000米以下。山地占全市总面积的72.2%，丘陵占15.9%。本市地形，因东面有大东山脉，由东北向西南;西部有大龙山脉，由西北向西南;北部有簸箕山脉，形成西、北、东三面山地，中部稍低，均为丘陵地带。星子、大路边、龙坪、保安等乡镇大部分地区为小盆地;清水、丰阳南部、东陂北部为丘陵盆地;西岸、东陂两乡镇河流两岸为河谷盆地;保安、附城及九陂等乡镇部分地区为丘陵盆地。

　　连州市主要河流有星子河，发源于大东山脉，发源地近处建有一个大型的潭岭水库。保安河、东陂河发源于北部簸箕山脉，还有连南瑶族自治县的三江河，流经本市连州镇高车墩村附近汇入连江